Należy dbać, aby dieta była zróżnicowana. Różnorodność w diecie wpływa pozytywnie na bogactwo gatunkowe mikrobioty.
Posiłki powinny mieć zbilansowane, proporcje rożnych grup produktów w diecie, z zachowaniem zaleceń wynikających z piramidy zdrowego żywienia i aktywności fizycznej opracowanej przez Instytut Żywności i Żywienia.